Agent K ist nun seit vier Jahren im Ruhestand. Als Agent J bei einer Routinekontrolle auf ein Komplott stößt, das er nicht allein bewältigen kann, bittet er seinen ehemaligen Partner um Hilfe. Der kann sich jedoch kaum an seine Zeit bei den Men in Black erinnern. Der Bösewicht wird für J zu einer besonderen Herausforderung: Die Gestaltwandlerin hat sich in ein Unterwäschemodel verwandelt, das die Herausgabe eines sonderbaren Lichts fordert - andernfalls wollen die Zarthaner die Erde zerstören.