Die Agenten Jim Phelps und Ethan Hunt erhalten den Auftrag, einen Verräter aus den eigenen Reihen der CIA zu überführen. Sie müssen verhindern, dass er eine Liste mit allen Namen der aktiven US-Spione aus Prag stiehlt. Die Mission gerät außer Kontrolle und alle Agenten außer Ethan kommen ums Leben. Weil Ethan daraufhin selbst unter Verdacht gerät, ein Maulwurf zu sein, muss er den wahren Verräter auf eigene Faust finden. Eine Hetzjagd beginnt.