Durch einen verheerenden Krieg, den nur wenige Zivilisationen überlebt haben, wird die Erde in ein wüstes Ödland verwandelt, auf dem sich ein Pilzwald ausbreitet, dessen Sporen für den Menschen hochgiftig sind. Durch natürliche Aufwinde, die das Eindringen von Sporen verhindern, ist das Tal der Winde eine der letzten fruchtbaren Oasen geblieben. Vom Tal der Winde aus bricht Prinzessin Nausicaä auf, um das Meer der Fäulnis, einen gigantischen Wald zu erkunden.